消基會、主婦聯盟/ 評估過程需嚴謹，開放資訊讓公民參與
對於烏魚養殖使用雌激素飼料的爭議，關心消費者權益和環保議題的公民團體的意見如何？
消費者文教基金會與主婦聯盟環保基金會都認為，除了檢測魚體有無殘留，環境荷爾蒙的風險也必須重視。不管要不要開放，政府都必須做好嚴謹的風險評估，評估過程應更公開透明，開放公民參與討論。也必須做好產品標示，讓消費者有所選擇，讓重視食安的消費群協助引導市場轉型。
消基會：飼料需嚴格管理，做好風險評估，如決定限用，產品標示需清楚
消費者文教基金會檢驗長凌永健認為，不應只是看生物體本身有沒有殘留，而應該關注更大的層面，也就是整個生態環境。「它可能不是針對你的目標生物，不只針對你的魚而已，在整個生態系裡面其他的物種，也或多或少有機會去暴露到。」
凌永健指出，過去大家所關注的許多環境荷爾蒙如戴奧辛，也都具有雌激素性質，會對自然生物的性別產生影響。建議政府應該針對烏魚養殖池用水與底泥，做更深入分析。
「我們很早就覺得農委會要對飼料去做管理，例如2003年我們在關注牛奶中的戴奧辛，歐盟是食品和飼料同時去訂標準，我們是食藥署有訂，但是飼料部分，農委會還是沒訂。」他也指出，政府在下命令之前，應該要有一個輔導管理，而不能只是禁令突然下來，漁民都沒有轉型與接受輔導的機會。
至於水產品安全的部份，凌永健表示，基於風險評估允許之下，可以接受「限用」，不一定要禁用。但是政府應該去輔導天然養殖，建立起嚴謹的管理模式，「要標示清楚，而且是誠實的標示，讓消費者能夠選擇。」慢慢去推，市場也可以去導引漁民轉型。
主婦聯盟基金會：基於預警原則，證明無害才能使用，呼籲開放公民參與
關心食安也關心環保的主婦聯盟環境保護基金會，研究員湯琳翔對此表示，「我們就是採預警原則，應該要證明對環境和人體都是無害的，才可以繼續使用。」漁業署對於業界普遍使用的現況，應該要做一些積極的研究和調查，才能釐清它對環境和人體的影響是什麼。
湯琳翔進一步期待，政府單位的研究和調查，能有公民參與的機會。他指出，政府常常遇到爭議就委託專家來做研究，但若是研究過程令外界無從置喙，公正性或獨立性仍會受到質疑。他舉例，原能會目前在做調查檢測，都會開放與公民團體討論，也召開多次公民參與平台會議。
「這樣我們就有比較多機會去審視研究團隊的組成、研究方法的設計，才能真正消除大家的疑慮。」湯琳翔認為，漁業署後續的研究與討論，如果能公開讓民眾陳述意見和參與，對於後續釐清這個爭議會更有幫助。
