台灣杭菊品質優良，不過農民多用分株法栽種，導致植株罹病了也難以分辨、進而衝擊產量。為提升國產菊花產能，種苗改良繁殖場（簡稱「種苗場」）先篩選出優良杭菊母株，再透過組織培養技術大量繁殖，並將健康種苗技轉給育苗廠商，希望從源頭替農民把關植株的健康。
種苗場場長張定霖表示：「有如優生學的概念，拿到健康的苗，管理上就比別人更輕鬆。」經篩選出的健康種苗，可改善許多植株先天不良的問題，後續栽培上也能減少補植人力成本、降低抗病藥劑使用量，達到友善環境的目的、讓食材生產更安心。
杭菊用量大，銅鑼最大產地
每年11月初杭菊花開，經過20天後就能採摘泡茶或作藥飲使用，國內杭菊栽種面積達75公頃，產區集中苗栗縣銅鑼鄉、台東縣台東市、卑南及太麻里等鄉鎮，其中又以銅鑼鄉為大宗、共有60公頃。但杭菊消費需求量大，國內每年僅能供應約60公噸杭菊濕花（相當於乾花30公噸），尚有一半消費量需仰賴進口。
植株罹病多，增加農民用藥需求
種苗場助理研究員邱燕欣表示，農民栽種杭菊多以分株繁殖法，即取植株側芽作為母株、隔年繼續種於田間，但如果挑選到罹染病害的母本，就可能讓病毒病在田間蔓延、影響產量，「過去都是農民自己留種，但是植株罹病時肉眼無法辨識，以為只是營養障礙、就一直補肥，但這些植株可能都已經感染到病毒病了。」
杭菊病害平均會減少三成產量，葉脈黃化、葉形縮小、開花數減少、花苞變小、淺根容易倒伏等症狀都是病徵。此外，弱勢植株還有生長期和開花期不一致、定植後存活率低、花色變異等問題，除提高農民管理成本，也增加用藥風險。
根據農業藥物毒物試驗所（簡稱「藥毒所」）105年公布的農產品農藥殘留監測報告中，曾抽驗國內杭菊產品95件，共有18件檢出農藥殘留、其中2件不合格。
此外，藥毒所也針對縣市別進行杭菊農藥殘留檢驗，苗栗縣共抽驗86件，檢出10件有農藥、其中1件不合格，台東縣則是抽驗9件，8件有農藥、其中1件不合格，不合格原因主要為農民使用了未推薦在杭菊上的藥劑。藥毒所在「杭菊病蟲害發生管理」手冊上也指出，杭菊經常檢出不合格農藥，如芬普寧、加保扶、大滅松、歐殺滅、亞托敏、普拔克、滅達樂和達滅芬等藥劑。
種苗場提供健康種苗，育苗業生產供應農友
為保障種苗的健康、讓杭菊栽種從源頭管理著手，種苗場花了一年半建立「杭菊健康種苗育成技術」。邱燕欣解釋，種苗場先選出性狀優良的母株，取其側芽利用組織培養技術進行無性繁殖，快速且大量的生產種苗，過程中會不斷透過分子檢測技術，檢測台灣杭菊常見的病毒及類病毒（包括CVB、TAV、CSVd），確保培育出的是健康的種苗。
種苗場負責上游端、生產健康母株，並將母株交給技轉商合興育苗場繼續育苗，農民可向育苗業者購買健康的杭菊植株、再定植田間。
「有如優生學的概念，拿到健康的苗，管理上就比別人更輕鬆。」種苗場場長張定霖表示，經組織培養獲得的健康種苗，可改善許多植株先天不良的問題，後續栽培上也能降低抗病藥劑使用量，達到友善環境的目的、讓食材生產更安心。
銅鑼農會：期待產量增加，降低整體售價
苗栗縣銅鑼鄉農會總幹事曾義孝指出，農會為響應友善土地的理念，多教導農民以苦楝油和蘇力菌防治蟲害，「但遇到病害只能趕快把植株挖走、移除，再覆蓋石灰，避免病毒持續擴散。」
曾義孝表示，清香、甘甜的白菊多泡茶飲用，香味較濃郁的黃菊則可入藥使用，此外，農會還開發面膜、清潔用品和杭菊麵線等商品。但當前國產杭菊一台斤售價800-1000元，難敵一台斤僅700元的中國杭菊。
而近年來銅鑼鄉農會與合興育苗場合作，至去年為止，皆由育苗廠商免費提供健康種苗給農民，當前銅鑼鄉已有一半產區改種經選育的健康杭菊母株，對於產能是否提升，他回應：「（杭菊）罹病率確實變低了、產量也有增加。」期待未來能提升國產杭菊產量、降低整體售價，不必再仰賴國外供給。
