被視為台灣沿近海漁業中相當重要的漁獲鯖魚，經研究發現其成熟體長有越來越短的趨勢，從過往的平均四十多公分一路下降至三十公分不到，除了讓魚價下跌重創漁民收益外，也成為資源枯竭的警訊之一。
為此，漁業署在2013年修訂《鯖鰺漁業管理辦法》，限制六月為禁漁期，希望讓海洋休養生息，然而連續執行多年後，鯖魚體型卻未見恢復，各界紛紛將可能的原因指向禁漁期的時間不正確，呼籲政府應針對現有的管制措施做調整。面對質疑，農政單位則強調目前還是以地方「自主管理」為優先，至於鯖魚禁漁期的調動，因需考慮多方因素，目前還尚在研議當中。
鯖魚為何長不大？據漁業署委託的「鯖鰺漁業資源調查報告」中指出，台灣近海花腹鯖的最大體長，從2004年的43公分一路下降到近年的37公分，關鍵就在2、3歲的成魚遭過度捕撈，鯖魚群體受到壓力，被迫提早性成熟，從2歲提前到1歲開始當媽媽，體長也連帶變小。
禁漁期訂在六月，但鯖魚2─4月產卵，保護效果有限
針對鯖魚產業進行多年研究的海大前校長李國添也指出，一般鯖魚產卵多在二到四月，而這段期間也是鯖魚最肥美的時候，漁民多會以俗稱「三腳虎」的扒網進行捕撈，不僅效率高、收穫量也豐，而五、六月則是小魚最多、成長最快的時段，當初漁民也是為了避開這段時間而自主休漁，最終漁業署才參考將六月訂為禁漁期，明載6/1-6/30禁漁，漁民不得在東北角海域（北緯24度以北之海域）進行捕撈作業，且離岸6海浬也是為禁漁區，百噸以上的鯖鰺漁船不得在台灣本島距岸12浬內作業。
儘管已訂出規定，並實行近四年，但時至去年九月，卻還有宜蘭漁民陸續捕獲拇指大的鯖魚，加上今年出現豐收價格滑落，為了讓漁業資源穩定，蘇澳區漁會也考慮於每年2月鯖魚產卵期自主休漁。
在外界將矛頭指向禁漁期時序不正確時，海龍王愛地球協會副理事長林于凱就解釋，我國禁漁期訂在六月，但彼時鯖魚已經產完卵了，要禁漁應該著重在三、四月的產卵期，好減低鯖魚的生存壓力；中研院生物多樣性研究中心執行長邵廣昭也表示，禁漁應該與生殖期相配合才有較好效果，建議漁業署可以用漸進的方式來改變。
李國添：建議延長禁漁期，讓海洋休養生息
對於各方質疑，海大前校長李國添則強調，無論任何沿近海的漁業都應該管理，且該配合國際脈動去調整，因為鯖魚不只台灣抓、中國抓、日本也會抓，但整體來看中國渤海、黃海禁漁期三個月、日本更長達五個月，我們卻只有一個月，從資源學的角度來看，禁漁期間應有所調整。
他也指出，二月鯖魚就開始陸續產卵，但那時東北季風強，本就不適合捕魚，而三、四月又是關係到漁民生計的月份，綜合考量下來，或許可將禁漁期延長到五月或七月，才能讓海洋休養生息。
民間團體：應讓社會瞭解友善漁法的重要性
長期關注鯖魚問題的「海鯖廻家」團隊也同樣表示，現行法訂的禁漁期，原本就不會有鯖魚經過，對於生態復育並無幫助與成效，但針對過度捕撈一味苛責一線漁民也無法真正解決問題，因此現在已經發起募資（https://www.fishreturnocean.com/），希望透過「72 小時獨木舟勇渡黑潮」的行動等，鼓勵民眾追隨鯖魚洄游路線，從台灣划300公里到日本石垣島，一來加深大眾對鯖魚產業的認識，二來也能從中瞭解友善漁法對環境的重要性，才有辦法從根本改變鯖魚所遇到的結構性問題。
推動永續漁業的湧升海洋創辦人徐承堉則認為，目前針對魚體縮小和漁獲波動等問題，其實各界並沒有一個較完整的定論，因為傳統漁場附近海域可能受洋流、水溫、氣候等各種因素影響，導致魚群的分佈有很大變動，而像鯖魚這種跨界魚種的管理問題，幾乎全世界都會遇到，若要做好禁漁期的調整，除了參考科學依據外，更必須考量到國際間的狀況，做好協調，否則僅依靠一方的管理也難有成效。
漁業署：先以「自我約束」來管理，情況惡化再介入
然而面對禁漁期延長或調整，可能衝擊漁民生計，蘇澳區漁會則認為，繁殖期休漁的問題，各界有不同看法，將斟酌一線意見後再行研議，同時現階段也有如自主休漁等的管理措施，希望減少對海洋的負擔。
對於各界的要求，漁業署副署長黃鴻燕表示，到底該選擇在產卵期禁漁，還是往後延長，會再多聆聽第一線的想法，同時參考足夠的科學數據後才會做出判斷，現階段漁業署較期盼相關團體以「自我約束」的方式來管理，不僅較有效率、漁民也不會有太多反彈，若情況持續惡化，政府才會思考以強制手段介入。
