除了鄉村社區自行組織的公民電廠，還有抱持著共榮經濟、能源民主理念的公民團體，也成立了公民電廠合作社，試圖透過傳播理念、在各地尋找屋頂，透過民間力量，配合躉購制度推進再生能源發展。
然而國內的這些合作社電廠目前規模都很小，面臨著共同的制度性困境，依法銀行不能融資給合作社，公有屋頂也都由大規模的商業電廠得標，在在使得公民團體難以突圍。
民間團體籌組綠能合作社，滿腔熱情卻被制度澆冷水
2015年再生能源躉售制度上路以來，在台灣有一群長年倡議反核減碳的行動者，試圖發展民間的再生能源。2016年，主婦聯盟環境保護基金會與合作社，成立了國內第一家公民電廠——綠主張綠電合作社。隨後2018年，新北市蘆荻社大師生成立「有限責任新北市庶民發電學習社區合作社」，淡水社區大學及地方社團也成立「新北市智慧綠能社區合作社」，2019年以金門大學教師為主成立「金門縣再生能源社區合作社」。
身兼行政院能源辦公室副執行長的台大政治系副教授林子倫指出，在德國的再生能源發展經驗中，相當鼓勵從集合住宅、合作社到小社區的能源建置，這些以人為主、而非以資本導向的組織，政府提供大量的行政與金融協助，讓公眾實際參與到能源轉型當中。
然而在台灣，合作社型態的公民電廠卻寸步難行。林子倫認為主要困境在於社會對「合作社」不夠熟悉，且合作社難以得到金融體系支持，必須自行集資支付一大筆建置成本，以至於不是被財務問題侷限，就是被政府招標制度、法規綑綁，無法充分發揮。相較之下，商業電廠跟銀行融資貸款卻是暢通無阻，承接公部門標案更是得心應手。
新北市智慧綠能合作社：銀行融資、公有屋頂招標，都獨厚商業電廠
創辦新北市智慧綠能社區合作社的許慧明，本身即為台電公司綜合研究所研究員，也身兼淡水文教基金會董事長。他表示，一般中小企業、甚至創業個人，向銀行貸款碰到授信困難，皆可申請政府所屬的「中小企業信用保證基金」擔保，但是這個基金擔保對象，卻唯獨排除合作社，造成公民電廠合作社融資困難，難以壯大。
許慧明更指出，政策提供20年的躉購電價保證收購，使銀行對光電業者融資管道大開方便之門，無形中是打開潘朵拉的盒子。
「有的光電業者大做無本生意，良莠不齊的業者四處簽約綁地開發。這些業者無心長久經營，等不了二十年回收期，把案場變成能源市場商品，多次轉手交易，這對簽約農漁民地主相當不利，也違背再生能源與農漁業共生精神。」許慧明直言。
「特別是政府目前盤點的各部會公有屋頂，有投標資格的幾乎都是光電統包業者，高額的押金與門檻，公民電廠合作社本身就難以參與，更別說鼓勵由公有屋頂所在單位學校的教職、員工合作社、福委會自行籌資開發。」許慧明痛批，政策之下，連政府機關的能源自主權也拱手讓給業者。
根植社區，才是真正的能源民主
「政府將公有屋頂聯合招標出租給光電業者，賺取微薄租金，但是根植於社區才能向下扎根，自己投資興建，才是真正的能源民主。」
許慧明提及，當初「電業自由化」鬆綁，是鼓勵所有公民組織、機關團體、企業都能夠機會均等參與發電事業，現在卻獨厚商業公司，公民社會參與陷入停滯，最終也讓能源轉型的論述停滯於概念，而非鼓勵行動。
「現在政府為了達成2025非核家園目標，政策上鼓勵業者衝量獲利，大面積設置，這種現象也反噬能源政策本身。」他解釋，越多民眾參與能源事業，能源價格才能逐步降低，「然而躉售電價居高不下，就是受到利益團體的阻擋。」
許慧明以身為台電員工立場，直言國內的躉購制度已扭曲，違背電業自由化精神。「台電公司一方面被要求高價收購綠能，另一方面又要照顧民生經濟，對外提供平價電力，這樣蠟燭兩頭燒，台電被迫買單，虧損則對外貸款，等同於慷全民之慨，獨厚一部分人。」
綠主張綠電合作社：光電變土地開發案，躉購制度變商業提款機
歷史最悠久的綠主張綠電合作社成立五年，期望民眾從能源的消費者轉為「共同生產者」。理事主席黃淑德認為，公民電廠都還在嘗試跟摸索階段，而商業模式發展光電跟公民電廠屬於完全不同的路徑，「光電業者決策簡單快速，資本越雄厚、發展速度越快。但是合作社要形成共識，速度必須慢。」她說。
黃淑德認為，綠能合作社的發展困境，仍是源於政府體制的觀念裡原本就沒有合作社的經濟民主概念。「美式經濟理論倚賴自由市場經濟，政府沒有意識到依賴商業模式的後果，以利滾利，光電投資完全沒有溝通成本跟時間成本，最後就變成土地整合開發案，誰有本領誰就去圈地。」
「嫻熟法規的土地開發者化身光電開發商，找一堆人到處獵地，二十年的躉購制度，就變成商業提款機。」黃淑德認為現今的綠能亂象，就是完全商業化的結果。
屋頂法規障礙多，公民團體優勢難施展
「相對的，屋頂型的光電設置太多障礙，合法土地、合法建照、使用執照，台灣的建築物，特別很多舊房子都無法取得使用執照。」黃淑德認為，社區的屋頂被建築法規綁住，而公有屋頂也囿於為企業量身打造的公開招標機制，綠能合作社難以支付高昂的押金、標金、保證金、租金、衍生稅金等等。
黃淑德指出，「民間的公民電廠往往沒有機電資格、資本額、統包資格都沒有，在公有屋頂釋出時，資格標就被剔除。無法參與競爭，公民團體的優勢深耕的在地教育、公益組織的學習力、凝聚力等就無法發揮。在這樣的市場制度下，小蝦米很難聚集成為一群具有影響力的蝦子。」
至於政府提出的《合作社及社區公開募集設置再生能源公民電廠示範獎勵辦法》，黃淑德認為，獎勵僅限一次，但核銷跟行政成本非常高且限制頗多，至今綠主張合作社仍未去申請。
庶民發電合作社：能源教育更需扎根
新北市蘆荻社大所催生的「庶民發電合作社」，可能是最不積極開發新案場的一家公民電廠。發起人李易昆表示，成立合作社緣起，是因為舉辦「節能參與式預算」課程而接觸能源轉型的議題，學員們花了很多時間在學習跟溝通，目前只設置三個案場。
「不衝量，也不求快，建置案場主要是為了讓學員參與實作，並非為了想要獲利。」李易昆強調，「那是蘆荻的工作方式，非常微弱，非常緩慢，才能形成一個空間，形成一個新事物。」他認為庶民發電合作社最重要的不是發電，仍是回到社大的教育使命：透過學習，培力人的成長，自我實現。
「庶民發電合作社主要是要讓一般素人認識能源轉型，得到自己對這個議題的看法，而非全盤接受政府的論述。」若回到培力能源公民、落實能源自主的進步意義，蘆荻社大自詡在國內的公民電廠光譜上，能拉出更平易近人與公民學習意義的一種範式。
