（20170615最新：農委會最新盤點「農地違章工廠13萬家！農委會：新設違章工廠年底拆一半 農舍為下一目標」請點選閱讀）
為確保台灣糧食安全，農委會估算全國農地總量應維持在74至81萬公頃之間；然而，依104 年農地現況資源分析結果，已有17%農地遭轉用。究竟農地上到底「長」了什麼？農委會現正進行全國農地盤點，現已完成九成盤查工作，盤查結果預計在六月底出爐、七月初對外公佈。
農委會企劃處處長蔡昇甫表示，下一步將以「2016年5月20日」作為分水嶺：520之後出現的未登記工廠採取「即報即拆」；520之前就已存在的未登記工廠將視其所在地進行處理，「如果在優良農地區內，就會輔導遷移；若在優良農地區外，則能轉為丁種用地，但業者需繳納生態補償金，做為農地保護基金」。優良農地區將待全國農地盤查結果出爐後再行劃設。
工廠佔用農地，2016年5月20日為分水嶺
農委會企劃處處長蔡昇甫表示，下一步將以「2016年5月20日」作為分水嶺：520之後出現的未登記工廠採取「即報即拆」；520之前就已存在的未登記工廠將視其所在地進行處理，「如果在優良農地區內，就會輔導遷移；若在優良農地區外，則能轉為丁種用地，但業者需繳納生態補償金。」優良農地區將待全國農地盤查結果出爐後再行劃設。
現按照經濟部五年一次的工商盤查結果資料顯示，全台目前約有6.9萬家未登記工廠，包括：新北市15,960家、台中市15,976家、彰化縣9,356家、台北市6,137家、台南市6,038家、高雄市4,856家、桃園市3,359家。
但蔡昇甫也坦言，現有總計546公頃的低污染未登記工廠散落在全台農業區、特定農業區、一般農業區、山坡地保育區等地，「這些工廠已取得臨時工廠登記證，須在輔導期限109年6月2日前符合環保、消防、水利、水土保持等相關規定。」在輔導期限前，無法強制遷移該廠，須待輔導期限後才能處理。
而違章建築拆遷工作實屬地方政府職掌，「接下來經濟部、內政部、農委會會想辦法督促地方政府落實執法。」
至於生態補償金會如何收取？蔡昇甫解釋，詳細計算方式仍需跨部會討論，但預計以「地目變更前後地價利差」、「占用農地時間」交叉計算，換算成生態補償金，以此做為「農地保護基金」，「而這筆農地保護基金可能用於劃設隔離綠帶、也可能做為新農業政策中的對地綠色直接給付基金。」
農地盤整後，將劃設生產專區
「農地盤整只是第一步！」蔡昇甫強調，待劃設出農地保護範圍後，下一步就是要讓農地集中化利用，「像是劃設生產專區。」目前新政府已下達明確指令推動「大糧倉計畫」，要求雜糧作物耕作面積要在四年之內增加2萬公頃，「待農地盤點完成後，就知道資源投注在哪裡比較有效率。」以解決農地破碎化問題。
另外，蔡昇甫也透露，由於農民銀行媒合效果面臨瓶頸，現農委會正與財政部、內政部討論如何增加國家耕地利用政策彈性。未來考慮在《農業發展條例》中增訂「轉租排除條款」，由農民團體、農民合作社或公正第三方作為租地媒合平台，只要農民或地主只要加入政府「促進農地利用方案機制」，就能突破目前《土地法》中的耕地不得轉租之限制。
外界普遍關心目前究竟有多少「農地」實為「農用」？優良農業區如何劃設？要劃設多少面積的優良農業區？蔡昇甫再三強調，一切都要等到六月底盤查結果出爐才能對外報告；待盤查結果出爐，也才能進一步規劃優良農地區、生產專區等耕地利用方式。
不合法 就應該拆，應該移，竟然要交錢就合法的，這是什麼爛政策…現在的工業區，幾乎跑光了，都到大陸設廠去了，工業區的用地取得並不難，為什麼還要放任違法者得利???還愈早違法，愈得利，這不是在鼓勵所有人民，違法的事早作就沒事嗎??大財團不敢得罪，連這種破壞環境的山老鼠也不敢得罪，真不知要這樣的政府還能作些什麼事。
…請問…是以什麼標準或什麼法條…要以…2016年5月20日起…那之前是無法可管？…或不想管？…或不想得罪前總統陳水扁及李登輝的執政團隊呢？
這些大官們要執行起來把13萬的違章工廠拆掉，我想台灣的經濟定一振不起，想想哪些大企業大財團有幾個繳稅的，還不是這些中小企業再繳稅，別在辦公室裡看台灣經濟，您們認為失業率太低嗎，13萬家違章工廠每家十個勞工就好所影響的是130萬人的工作機會數百萬家庭的生計，綠色執政餓死保證ㄛ！真是挫尿換閃屎ㄟ(國民黨換民進黨)，台灣郎足苦憐，種田的就是一輩子種田嗎？一年收成二季能賺多少錢啊，請農委會高官們下鄉走走徹底了解民間疾苦啦！
丁種建地後則為一坪3.5萬元?,廠商有機會變更地目後增加之市值還是很划算 —
動這13萬間工廠就是動搖國本，先想好配套措施再說。不要說把法給立了，就把責任全推給民間。如果不是政府長期的默許，能有可能存在這些工廠嗎？，當政府收稅收的笑喝喝時，怎沒聽說這些工廠非法呢？！別只會想到什麼就做什麼。橫幹蠻幹完全不知百姓的疾苦。大陸雖說共產主義，但凡有政策關聯動遷，無不先做好事前規劃建設。所以大陸這幾年的城鄉發展才會如此驚人。檢討一下吧，我偉大的中華民國政府！
佔用農地違法就是違法，為什麼可以「在地合法」？為了選票就可以和稀泥？