馬太鞍溪經歷去年「923潰壩」與後續風災重創後，行政院通過《花蓮馬太鞍溪堰塞湖災後重建特別條例》，編列 300 億元特別預算（執行期限至 2027 年 3 月 31 日）。其中約 98.9 億元用於水利設施，核心工程與衝擊範圍包含：
- 主流與支流防洪工程：主流南北兩岸將興建超級堤防。南岸採雙重堤防設計（興建超級堤防，相隔 200 公尺再建第二道堤防，中間作為貯砂空間）；北岸則自堤防往陸地劃設 740 公尺河川治理線作為土砂堆積與洪水預備區，治理線末端並興建「保護工」（第二道防線）。
- 匯流口防護：為保護阿陶莫與加禮洞部落，計畫自馬太鞍溪與花蓮溪匯流口向北至萬榮溪興建寬 100 公尺、高 8 公尺的堤防，並外劃 155 公尺第二道堤防作為疏濬通道；支流（如瑪達娜溪、羅莫溪）則由花蓮縣政府負責背水堤與加高工程。
因應上述工程，光復、鳳林、萬榮將面臨龐大的土地徵收壓力。
土石危機與懸河困境
去年 9 月堰塞湖溢流帶下 3,000 萬立方土石，水利單位清理約千萬方後，11 月鳳凰颱風僅半天雨勢又帶下 1,000 萬立方公尺；目前上游估計仍有 2.4 億立方公尺土石尚未下移。水利署評估未來 10 年僅有能力疏濬 7000 萬立方公尺。也就是說，即便耗費鉅資、大量徵地，亦無法徹底保證居住安全。
如今上中下游堆積的巨量土砂已導致河床抬升十多公尺，形成「懸河」，不僅將支流水無法排出的溢淹風險轉移給下游部落（如阿陶莫、加里洞），學者也擔憂此類硬體工程在缺乏充分專業水理分析與在地溝通下強行推動，將限縮災區中長期的空間發展與產業可能。
