自從1996年總統候選人彭明敏喊出海洋國家口號，開啟政黨將海洋政策作為競選議題迄今已歷時19年，今（16）立法院終於三讀通過《海洋委員會》組織法草案，確定行政院將成立海洋委員會，並下設海巡署、海洋保育署、海洋研究院等3個單位。
不過當初審查草案時，就受外界不少「疊床架屋」的質疑，但學者多認為政府應有一職司海洋事務的專責機構，才有利於海洋資源的長程政策規劃和發展，未來最須加強組織間的溝通、協調。
從「海洋部」到「海洋委員會」，確定統領海洋保育署、海洋發展研究院、海巡署
我國最早和海洋保育事務相關的行政法規，為1998年的《中華民國專屬經濟海域及大陸礁層法》。一次政黨輪替後，一度有設立「海洋事務部」的呼聲，行政院也在2004年設立行政院海洋事務推動委員會（簡稱海推會），作為跨部會的平台，同時還制定了「國家海洋政策綱領」、「海洋政策白皮書」等發展願景。
不過在立法時，民進黨政府一直處於「朝小野大」的情況，因此即使從海洋事務部、改成海洋委員會，法案都未獲多數支持；二次政黨輪替後，現任總統馬英九提出「藍色革命、海洋興國」的政策藍圖，並在2011年由行政院提交《海洋委員會》草案，在今（16）日經立法院三讀通過。
海洋委員會確定將納入現有「行政院海巡署」，並新成立「海洋保育署（簡稱海保署）」、「海洋發展研究院」2個新單位。分工上，海保署「相當於大腦」，將針對海洋資源保育、汙染防治進行政策研擬，並納入部分環保署海洋汙染科人員；海巡署則是「身體」，除負責業務既有海域安全、海洋領土保衛及人口販運等，還要執行海保署研擬的政策。而海洋發展研究院則以海洋研究、人員訓練為主。
和漁業署、環保署業務重疊？ 學者：海保署從海洋角度出發，有存在必要
不過海洋委員會的成立過程，備受外界質疑。首先是海保署職司的「海洋資源保育」，和既有漁業署業務重疊。
海龍王愛地球協會副理事長林于凱說，未來海保署掛牌上路後，漁業署負責養殖、遠洋等整體漁業經濟發展，並管理經濟魚種像鮪魚、旗魚、烏魚等的捕撈數量；但是海保署是「全部都要納入規劃，不管是不是經濟魚種。」
林于凱說，現行我國最嚴格的海洋保護區，屬於漁業署劃設的禁漁區，和台江、墾丁、澎湖、東礁等4個國家公園，其次是國家風景特定區、野生動物保護區、自然保留區等單位，但是只有禁漁區和國家公園等級執法最嚴格。
他說，由於我國長期缺乏單一主管海洋機構，許多政策法令都落後許多國家。像是澳洲，就已將鄰近海域劃分為7個區域進行管理，而在保護區中還會分為核心不可使用區、部分觀光區、部分須申請才能進入等規劃。而未來，如果台灣有設立離岸風力發電機的需求，「除了海保署外，行政院有哪個部會可以就專業立場來分析開發案？」
另外，海保署的海洋汙染防治業務，是否和環保署（未來環境資源部）重疊，甚至海洋垃圾多數來自陸地，將如何分工？林于凱說，海保署和環保署明確的分工，是以河口切分，但是「的確海洋垃圾有許多來自陸上，因此跨部會的合作和協調很重要。」
曾任台灣海洋中心主任的海洋大學教務長龔國慶表示，表示曾有環保署人員向他反映環保署自身「缺乏處理海洋垃圾的專業知識和經驗，」因此只要將組織分工清楚劃分、清楚定位、確實移撥，就能落實組織改造的政策願景，「短期內難免有『疊床架屋』的現象，但運作久了、經協調，就能上軌道。」
一度海洋委員會只有「海巡署」，軍方任職成爭議
其次，較受爭議的是海保署的人事問題。在今日立法院三讀通過確定以前，海洋委員會下設機構曾只有海巡署一單位，由於海巡署由軍方、警察和文職人員組成，一度曾傳出將派軍方人員負責海保署的職務，引起「軍人任文職」的反彈。
不過，在《中央政府機關總員額法》的規定下，確立中央政府員額最高為17萬人，因此海保署、海洋研究院的成立，必然得由現存機關進行移撥、整併。所以當海巡署人員「移撥」到海保署時，就受到強烈「武人干政」的質疑，同時也有「海洋保育專業知識不足」的疑慮。
今天三讀通過，確立海洋委員會軍、警、關務人員不得超過1/2，而海洋研究院不能有軍警職，屬純文職機構；海洋保育署以文職為主，但視任務需要，薦任以下職等官職可由警察、軍職、關務人員派任，而海巡署則無限制。
海洋資源潛力無窮，卻乏專責單位研究、評估
他進一步說，雖然海洋委員會的格局和「海洋部」仍有差異，但未來海洋委員會若能有效運作，也能擁有政策分析、規劃、執行的格局；在現行缺乏專門海洋組織的情況下，許多海洋資源都無法有效使用。
龔國慶舉例，像是深層海水開發，由於缺乏海洋專門部門，因此就交由「水利署」負責；島嶼的使用，依現行法規是屬於「營建署」管轄，都未納入「海洋」的整體概念。而目前國際間仍在研究、有望成為新興能源的「甲烷冰（天然氣水合物）」，且經過初步探勘，在高雄外海有大量儲存。
甲烷冰主要由90%的甲烷構成，其他成份包括乙烷、丙烷、丁烷、氮氣、二氧化硫、硫化氫等物質，主要是由於在低溫、高壓的環境下，水分子會形成特殊的結構將氣體分子包覆其中。
龔國慶說，「目前台灣仍沒有開採甲烷冰的技術，」但是未來海洋委員會若順利運作，並成為專責機構，就能針對開採技術進行研究、試驗，並評估開採對海洋環境的衝擊。除了自身開採、減少對國際石油的依賴外，「甚至還能技術輸出，」而這些都仰賴「海洋委員會的健全運作。」
環團於2013.6.8於凱道遊行，呼籲「台灣需要海洋部」，如今海洋委員會正式成立，總管海洋事務，受到各方矚目（圖片提供/魚凱）
